Superpies Krypto i Superman to nieodłączni przyjaciele, którzy dzielą te same supermoce i razem walczą z przestępstwami w Metropolis. Kiedy Superman i reszta Ligi Sprawiedliwości zostają porwani, Krypto musi przekonać zwierzęta ze schroniska do opanowania swoich nowych mocy i pomóc mu uratować superbohaterów.

Po osiedleniu się w Green Hills, Sonic jest chętny do udowodnienia, że ma to, czego potrzeba, aby być prawdziwym bohaterem. Jego test przychodzi, gdy Dr Robotnik wraca, tym razem z nowym partnerem, Knuckles, w poszukiwaniu szmaragdu, który ma moc zniszczenia cywilizacji. Sonic łączy siły ze swoim własnym pomocnikiem, Tailsem, i razem wyruszają w podróż po całym świecie, aby znaleźć szmaragd, zanim wpadnie w niepowołane ręce.