Minionki Kevin, Stuart, Bob oraz Otto muszą ratować młodego Gru, który popadł w konflikt z grupą super złoczyńców znaną jako Vicious 6.
Życie legendarnego łowcy morskich potworów zostaje wywrócone do góry nogami, gdy na jego statku zaszywa się młoda dziewczyna.
Po osiedleniu się w Green Hills, Sonic jest chętny do udowodnienia, że ma to, czego potrzeba, aby być prawdziwym bohaterem. Jego test przychodzi, gdy Dr Robotnik wraca, tym razem z nowym partnerem, Knuckles, w poszukiwaniu szmaragdu, który ma moc zniszczenia cywilizacji. Sonic łączy siły ze swoim własnym pomocnikiem, Tailsem, i razem wyruszają w podróż po całym świecie, aby znaleźć szmaragd, zanim wpadnie w niepowołane ręce.